1、适用范围不同独立样本t检验的数据来源是独立的样本，如同一个班级中男生和女生的成绩是否有差异；而配对样本t检验的范围是同一组对象，例如一个班级中的女生排名较好次月考和排名较好次月考的成绩是否有差异。2、数据性质不同独立样本t检验中的各实验处理组之间毫无相关存在，即为独立样本，该检验用于检验两组非相关样本被试所获得的数据的差异性；而配对样本t检验的数据是检验匹配而成的，用于检验匹配而成的两组被试获得的数据或同组被试在不同条件下所获得的数据的差异性，组成的样本即为相关样本。3、t检验统计量计算公式不同独立样本t检验统计量为：其中S1^2和 S2^2为两样本方差；n1 和n2 为两样本容量。而配对样本t检验的统计量为：其中，Sd为配对样本差值之标准偏差，n为配对样本数。
语言配对t检验样本量计算
在R语言中pwr包给我们提供了一系列的样本量计算公式，t检验的样本量计算公式如下：
pwr.t.test(n = NULL, d = NULL, sig.level = 0.05, power = NULL,
type = c("two.sample", "one.sample", "paired"),
alternative = c("two.sided", "less", "greater"))
其中，n是样本量，d为标准化的均值之差，sig.level为检验水平，power为减压功效，type为检验类型（单样本、配对等），alternative单双侧检验，默认为双侧。